Народився 9 серпня 1970 року. Розквіт кар'єри захисника припав на 1990-ті роки.

З 1990 по 1995 роки був ключовим гравцем дніпропетровського «Дніпра», звідки почав викликатися до національної збірної. З 1995 по 1998 роки виступав за київське «Динамо», куди перейшов у групі провідних гравців «Дніпра». Протягом наступних років грав в українських та закордонних клубах («Ворскла», ЦСКА, «Таврія», «Факел», «Мехелен» Бельгія, «Ерзурумспор» Туреччина, «Актобе» Казахстан).

Сергій Беженар — учасник історичного першого матчу збірної України проти Угорщини, який відбувся 29 квітня 1992 року. Загалом за збірну України провів 23 матчі (з 1992 по 1997 роки). Також залучався до юнацьких та молодіжних збірних СРСР.

Завершивши ігрову кар'єру перейшов на тренерську діяльність. Після досвіду роботи з професійними клубами («Кримтеплиця», «Фенікс-Іллічовець»), з 2012 року Сергій Миколайович присвятив себе вихованню молоді.

Працює у ДЮФШ «Динамо» (Київ) з командами різних вікових категорій. З 2026 року очолює групу U17. Як ексзахисник «біло-синіх», приділяє особливу увагу оборонним нюансам: позиційній грі, техніці відбору та грі головою.

«Запрошення до школи «Динамо» було несподіваним, але я погодився одразу, - згадує Сергій Миколайович. - Робота з дітьми має свою специфіку: тут важливо не просто давати навантаження, а навчати фундаментальним речам у чудовій робочій атмосфері».